单细胞免疫组库(V(D)J)测序

2025-12-09 11:15 来源:丁香园 作者:上海旭燃生物科技有限公司
字体大小
- | +

技术原理

1.png

(10x Genomics单细胞转录组为例)
 

1. 形成GEMs 基于微流控芯片形成油包水(GEMs),每个油包水内含有一个细胞、一个gel bead以及逆转录需要的引物试剂和酶等,单个GEM内可进行独立逆转录反应互不干扰。 

2. 标记细胞和RNA分子 Gel bead上带有标签,GEMs进行逆转录,可将10x barcode(10x BC,用来标记细胞)、UMI(标记本底RNA进行定量)加在每个mRNA分子上。

3. 巢式PCR富集全长V(D)J序列 基于T细胞和B细胞VDJ序列设计巢式PCR引物,富集全长V(D)J序列

实验流程

2.png

技术优势

1)可实现成对的重链和轻链(B细胞)或α和β链(T细胞)的全长测序;
2)精细到单细胞水平,能获得大量单细胞的免疫组库数据;
3)同批样本可同时获得mRNA表达谱数据和免疫组库数据;

单细胞平台兼容性

3.png

数据分析

分析流程

4.png

分析结果展示

5.png

研究方向

1)抗体的鉴定和新抗体的发现
2)揭示Ig 库的发展,绘制全局Ig 库
3)研究传染性疾病,如感染发展中的抗体进化谱系等
4)研究免疫失调疾病的V(D)J 重组倾向性,寻找免疫失调疾病的标记物
5)癌症早期检测、癌症进程和复发诊断的标记物以及肿瘤免疫机制的研究

送样要求

6.png

 >>点击咨询


查看信源地址

编辑: 李晶辉

版权声明

本网站所有注明“来源:丁香园”的文字、图片和音视频资料,版权均属于丁香园所有,非经授权,任何媒体、网站或个人不得转载,授权转载时须注明“来源:丁香园”。本网所有转载文章系出于传递更多信息之目的,且明确注明来源和作者,不希望被转载的媒体或个人可与我们联系,我们将立即进行删除处理。同时转载内容不代表本站立场。

  • App下载