磁珠团聚可能对实验造成的若干影响

2025-09-04 17:49 来源:丁香园 作者:
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在核酸提取过程中,磁珠团聚(即磁珠非特异性聚集或结块)确实可能对实验结果产生显著影响,需根据具体情况进行判断和优化。点击了解核酸提取磁珠

以下是详细分析及解决方法:
1. 磁珠团聚的潜在影响:
①核酸提取效率下降
有效表面积减少:团聚导致磁珠与核酸接触面积降低,结合容量下降。
洗脱不完全:团聚体内部包裹的核酸难以释放,导致产量偏低。
②实验结果不稳定
重复性差:团聚程度不可控,导致批次间回收率波动(如 qPCR Ct 值差异大)。
纯度降低:团聚可能吸附更多杂质(如蛋白质、多糖),影响 A260/A280 和 A260/A230 比值。
③操作障碍
磁分离困难:大团聚体沉降速度快,但可能导致未结合的核酸被机械截留。
吸液残留:团聚体易附着枪头,造成样本损失。

2. 磁珠团聚的常见原因:

①磁珠质量问题:粒径不均一、表面修饰不完全(如硅羟基分布不均)、磁性材料氧化。
②样品性质干扰:高粘度(如中草药多糖)、高盐浓度、pH 偏离最佳范围(如 pH<4 或>9)。
③操作不当:涡旋过度、磁珠长时间暴露于磁场、洗涤液未彻底混匀。

3. 解决方案与优化措施:

①磁珠选择与预处理
选用优质磁珠:选择粒径均一(如 13 μm)、表面包覆完整(如二氧化硅层)的磁珠(推荐品牌:Dynabeads、MagCapture)。
预洗磁珠:使用前用 70% 乙醇或缓冲液悬浮磁珠,去除生产残留的稳定剂。
②样品处理优化
降低样品粘度:  
对多糖丰富的样本(如植物组织),添加 纤维素酶 或 稀释裂解液;预离心(12,000 rpm, 5 分钟)去除不溶物。  
调节 pH 和盐浓度:  
维持结合缓冲液 pH 在 68(硅基磁珠最适范围),盐浓度按说明书调整(如 NaCl 终浓度 0.51 M)。
③操作关键点
温和混匀:使用移液器轻柔吹打或水平摇床混合(避免涡旋),确保磁珠均匀悬浮。
控制磁场时间:磁分离时间不超过 23 分钟,避免磁珠长时间聚集。
分步结合:对高浓度核酸样本,分次加入磁珠(如先加 50%,混匀后再加剩余部分)。
④团聚后的挽救措施
超声处理:短暂超声(510 秒,冰浴)分散团聚体(需测试 RNA 是否降解)。  

总结:

磁珠团聚会显著降低核酸提取的效率和可靠性,但通过优化磁珠质量、样本前处理和操作流程可有效避免。若实验中出现团聚:  

1. 优先预防:选择合规磁珠并严格按 protocol 操作;  
2. 及时干预:调整缓冲液或分散磁珠;  
3. 质控必做:通过电泳和 Nanodrop 验证提取效果。  

建议首次使用新品牌磁珠时,先进行小规模测试以评估团聚风险。点击了解领骏生物核酸提取磁珠

编辑: 朱卿

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