提取核酸的时候磁珠团聚结块怎么办?

2025-09-04 16:56 来源:丁香园 作者:
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在核酸提取过程中,若磁珠出现团聚结块,会导致核酸结合效率下降、洗涤不彻底或回收率降低。分析以下原因和解决办法 (核酸提取磁珠,点击了解详情)

一、磁珠团聚的常见原因
1. 磁珠储存不当:反复冻融、长期置于高温或剧烈震荡。  
2. 缓冲液问题:裂解液或洗涤液 pH 异常、盐浓度不当或含有沉淀。  
3. 操作不当:混匀不充分、磁珠干燥过度或静置时间过长。  
4. 样本问题:高粘度样本(如全血、植物组织)或过量杂质(多糖、蛋白)。  

二、解决方案
1. 磁珠预处理
涡旋重悬:使用前剧烈涡旋磁珠悬液 ≥ 30 秒,确保完全分散(肉眼观察无沉淀)。  
短暂离心:低速离心(2000 rpm, 5 秒)使管壁液滴聚集,便于重悬。  
超声处理(可选):对顽固结块,用水浴超声仪短暂超声(10 秒,避免产热)。  
2. 优化操作步骤
充分混匀:加入磁珠后,立即用移液器吹打 10 次或涡旋 10 秒,在裂解和洗涤步骤中,每步混匀需彻底(避免磁珠吸附在管壁)。  
避免磁珠干燥:乙醇洗涤后尽快进入下一步,干燥时间 ≤ 10 分钟(肉眼见磁珠微湿润)。  
控制静置时间:磁珠结合核酸时,静置时间按说明书操作(通常 3-5 分钟),过长易结块。  
3. 调整缓冲液条件  
检查缓冲液 pH 和盐浓度:  
裂解液 pH 应为碱性(如 pH 8.0-8.5),若沉淀需更换新批次。  
确保洗涤液(如 80% 乙醇)新鲜配制,无水分挥发导致的浓度变化。  
添加助悬剂(谨慎使用):对高粘度样本,可加入 0.1% Tween-20(终浓度)改善分散性(需验证兼容性)。  
4. 样本优化
稀释或预处理:  
高粘度样本(如全血)用缓冲液稀释后再裂解。  
植物/真菌样本先用液氮研磨或 CTAB 法去除多糖多酚。  
减少样本量:  
结块严重时,降低样本起始量(如血液从 200μL 减至 100μL)。  
5. 磁珠保存与质量控制
正确储存:磁珠保存于 2-8℃(避免冷冻),使用前平衡至室温。  
验证磁珠活性:取少量磁珠加入清水,正常应均匀分散;若结块则提示磁珠失效。  

三、紧急补救措施
若实验中发现磁珠结块:  
1. 暂停实验:立即涡旋或吹打尝试重悬。  
2. 延长结合时间:结块时延长核酸结合时间至 10 分钟(轻柔摇晃)。  
3. 离心后重悬:低速离心(1000 rpm, 1 分钟),吸弃上清,用新鲜洗涤液重悬。  

四、预防措施
分装磁珠:避免反复冻融和长时间室温暴露。  
定期校准移液器:确保试剂体积准确,避免盐浓度偏差。  
选择低吸附耗材:使用硅化离心管减少磁珠粘附。  

问题排查表                                                                                       

现象可能原因解决方案
磁珠沉底不分散储存不当/过期涡旋+超声,更换新批次
结合后结块样本杂质过多稀释样本或增加预处理
洗涤时结块乙醇浓度不准新鲜配制 80% 乙醇


通过以上方法,可有效解决磁珠团聚问题。若持续存在,欢迎点击咨询上海领骏生物。

编辑: 朱卿

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