中国科学技术大学孙成教授等人近期研究表明，通过分析肿瘤微环境中免疫细胞的空间分布，能精准预测肝癌患者术后复发风险！这项发表在《Nature》的「Spatial Immune Scoring System Predicts Hepatocellular Carcinoma Recurrence」研究论文，创新性地结合空间转录组学、蛋白质组学和多重免疫组化技术，开发出全球未研究的肝癌复发预测模型——TIMES 评分系统，揭示肿瘤微环境中免疫细胞空间分布与肝癌复发的直接关联。文中所用高分辨率空间转录组技术（DSP-WTA）（点击了解详情）由非因生物团队支持完成。
研究思路
实验方法
一、数据收集与空间异质性解析
1. 利用 10x Visium 技术对 17 例 HCC 组织（6 例复发，11 例未复发）进行空间转录组分析，划分肿瘤侵袭前沿（IF）、中心（TC）和邻近基质（AS）三个区室，并鉴定 NK 细胞在 IF 和 TC 的富集差异。
2. 通过多重免疫组化（mIHC）验证 61 例患者的 NK 细胞亚群（CD3⁻CD57⁺成熟 NK 细胞与预后显著相关）。
二、生物标志物筛选与模型构建
1. 利用 DSP-WTA 技术（由非因生物提供）对 8 例 HCC 进行分析，筛选出 241 个差异表达基因（DEGs），结合单细胞 RNA 测序和蛋白质组学（LC-MS/MS），最终锁定 5 个 DEGs：SPON2、ZFP36L2、ZFP36、VIM、HLA-DRB1。
2. 基于 XGBoost 算法构建 TIMES 评分系统，整合 IF 和 TC 区 5 个生物标志物的空间表达模式，生成 0-1 分的风险评分。
三、功能验证与机制研究
1、体外实验：
3D 生物打印模型模拟肿瘤微环境，验证 SPON2⁺ NK 细胞通过 IFNγ 激活 CD8⁺ T 细胞的机制。
2、体内验证：
Spon2 敲除小鼠模型显示，NK 细胞特异性缺失 SPON2 导致肿瘤生长加速（P = 7.8×10⁻³）、免疫浸润减少，证实其抑癌功能。
四、多中心验证与临床转化验证
1、多中心队列验证：
1）在 231 例患者的 5 个多中心队列中验证，TIMES 评分准确率达 82.2%，AUC = 0.82，显著优于 TNM（0.51）和 BCLC（0.53）分期系统。
2）分层分析显示，TIMES 对早期 HCC（TNM 期）的预测效能尤为突出（P = 3.0×10⁻⁷）。
2、免疫治疗相关性探索：
接受抗 PD-1 治疗的患者中，高 TIMES 评分者缓解率显著更高（P = 1.61×10⁻³），提示其可能作为免疫治疗疗效预测指标。
3、工具开发：
开源在线平台，支持病理图像上传，实现动态风险评估。
研究结论
作者提出 TIMES 作为一种潜在的 HCC 复发预后工具，它整合了空间免疫信息，以超越传统临床因素进行风险分层。文中的功能研究获得的生物学见解为未来研究 SPON2+ NK 细胞在 HCC 生物学中的作用提供了途径。随着研究者探索 TIMES 在其他癌症类型中的适用性，这项工作为早期 HCC 以及潜在的其他实体瘤的更个性化管理策略奠定了基础。
非因总结
研究团队运用非因 DSP-WTA 空间全转录组技术（点击了解详情），对肝癌组织中 CD3−CD57+ NK 细胞进行单细胞级空间解析，结合单细胞测序、机器学习等，筛选出跟复发密切相关的 5 个关键基因，为开发基于空间免疫信息的预测工具 TIMES 评分系统提供了基础。
非因 DSP 数字空间多组学技术，能够在组织形态学染色的指引下，以空间分辨率的数据，揭示特定区域内的基因（18000 重）和蛋白质（570 重）在组织中的精确位置和表达水平，助力科研工作者深度解析肿瘤异质性和肿瘤微环境。
非因生物在空间多组学领域有着丰富的项目经验：60 余种特染抗体开发、300+项目服务，助力发表空间多组学文章 40 余篇，累计影响因子 522+，平均影响因子 14+。公司配备 3 台 DSP 仪器同步高效运行，是国内规模最大的 DSP 数字空间多组学技术服务商。
