【2024 年 11 月 6 日,中国·上海】在全球生命科学领域享有盛誉的 New England Biolabs(NEB)迎来了其第八届创新技术论坛。本届论坛以「激情五十载 科学创未来」为主题,汇聚了国内外的科研精英、行业领袖和学术专家,共同探讨后疫情时代的科学创新和生命科学领域的最新进展。同时,NEB 海内外重要领导及国内所有员工与中国科学家们一起,共同庆祝 NEB 成立 50 周年。
本次论坛的议题涵盖了 表观遗传学、合成生物学、高通量 DNA 组装和蛋白纯化的最新进展。同时,还涉及辅助生殖相关的疾病诊断、糖组学在体外诊断的应用和 RNA 药物开发工艺等多个主题。NEB 总部的研发科学家团队还介绍了 NEB 在后疫情时代的产品开发理念,以及最新的测序技术和产品。
本次论坛开幕式由 NEB 中国总经理黄永亮博士( Dr. Timothy Wong)主持,他在开幕致辞中表示:「NEB 一直致力于为科研工作者提供最前沿的科学工具,并搭建学术交流的平台,推动生命科学的不断进步。自 2016 年以来,NEB 已经在中国成功举办了七届创新技术论坛。今年是 NEB 成立 50 周年,同时 NEB 中国卓越中心也正式启动。我们非常高兴能在上海举办 NEB 中国第八届创新技术论坛。这次盛会汇聚了顶尖科学家、研究人员和行业专家,旨在促进学术交流和激发科学热情。我们希望这次论坛能激发新的想法,促进合作,并为科学技术的持续进步做出贡献。」随后,NEB 全球首席执行官 Dr. Salvatore Russello 及全球业务执行总监 Dr. Carole Keating 在开幕祝词视频中表示:「短短五十年的时间,分子生物学工具的革新,使科学家们可以问的问题发生了革命性改变,并且不断推动着我们诊断技术的进步。我们想告诉大家这个领域如此地令人激动,我们今天的研究一定会影响未来 50 年的世界,我们希望通过举办 NEB 科学技术论坛,有机会建立起跟科学家之间的联系,互相激励来促进合作,我们期待能够支持客户的工作,让世界更美好、更安全。NEB 创新技术论坛是我们分享知识、促进合作并且探索这些关键领域最新进展的独特机会。」
精彩回顾
NEB 应用与产品开发执行总监 Dr. Nicole Nichols 带来了题目为《后疫情时代的产品开发》的演讲。Dr. Nicole Nichols 在 NEB 管理杰出的开发团队,负责将新产品从概念验证阶段引导至商业化,并在产品发布后继续支持客户和合作伙伴。Dr. Nicole Nichols 讲述了在后疫情时代产品开发所呈现出的新趋势和挑战,如何共同驱动未来业务和产品线的发展,以及 NEB 针对这些特点进行产品开发采用的战略和策略。
Dr. Nicole Nichols, Executive Director
Applications & Product Development, NEB
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心徐国良院士带来《白血病中 TET2 突变使其氧化胸腺嘧啶》的报告。徐院士先是娓娓道来了 DNA 甲基化的背景知识以及其课题组在不同生物当中发现的 DNA 甲基修饰的重要作用,然后展示了其团队的最新研究成果。研究发现,TET2 突变改变了 TET2 的底物特异性,从作用于甲基胞嘧啶转变为胸腺嘧啶;并在细胞水平上证实了 TET2 的突变会导致 DNA 损伤和 DNA 损伤响应基因的转录激活,为白血病的治疗提供了新的方法和思路。
徐国良 中科院院士
中国科学院分子细胞科学卓越创新中心
浙江大学生命科学研究院首席研究员,阮一骏教授进行了题为《单细胞及单分子分辨率中的 3D 表观遗传学》的报告。阮教授介绍了团队开发的新技术 ChAIR (Chromatin accessibility, interaction and RNA in single cell),在单细胞水平上,可通过结合 ATAC-seq、RNA-seq 及 PET 数据,揭示一群单细胞内或小鼠体内不同类型细胞中的基因转录与染色质结构的关系,并鉴定远距离增强子。正在开发中的 ChIA-drop 技术,能在单个细胞水平整合 DNA、RNA 和蛋白质的信息,将成为更有力的研究工具。
阮一骏 首席研究员
教授浙江大学生命科学研究院
来自 NEB Research/Genome Biology Division 的杰出科学家 Dr. Sriharsa Pradhan,带来题为《使用双功能切刻酶对染色质进行表观遗传学表征从而实现 Lamin B1 和 B2 功能性表征分析》的报告。介绍了使用切刻酶对染色质进行表观遗传学分析的方法。Dr. Pradhan 在演讲中提到:基因表达与甲基化有密切关系,了解正常组织中的 PTM 和 TF 结合模式以及它们在病理状态下的变化,可以为疾病诊疗提供关键的线索。因此详细阐述了其开发的 NEED-seq 测序方法,该方法应用于细胞核时,NEED-seq 能够绘制出与染色质相关蛋白质和组蛋白 PTMs 的全基因组图谱。通过该方法对 lamin B1/B2 进行 NEED-seq,显示出它们与异染色质的关联,证明其在哺乳动物细胞核中具有结构和功能的分区。
Dr. Sriharsa Pradhan, Distinguished Scientist,
Research/Genome Biology Division, NEB
接下来,中科院深圳先进技术研究院的罗小舟研究员,做了题为《数据驱动的合成生物底盘菌株构建》的报告,报告指出,自然界一直是分子多样性的宝库,在过去的二十年里,天然产物及其类似物的生物合成极大地推动了微生物领域的研究。但我们对构成这些合成途径基础的微生物底盘仍然了解不足。众所周知,蛋白质的一级结构决定了其三维结构,并影响其生物学特征,罗小舟研究员详细介绍了团队为了理解其中更深层的生物学逻辑,通过合成生物自动化和人工智能等工具的帮助,在多个层面上成功设计了微生物底盘——从单个元件到整个系统,团队构建了 UniKP:基于 Transformer 嵌入的动态参数预测器,可以显著区分酶及其突变体的 Kcat 值。报告还提出了一种基于序列的嗜热蛋白预测框架 ThermoFinder。该方法在 3 个分类数据集上实现了 SOTA 性能,并首次实现了从蛋白质序列出发的最佳催化温度预测。研究成果表明,利用这些工程化的系统,可实现了多种化合物的高效生物合成,并有望将其推动到产业化,为合成生物学创造了更加可预测的进化空间。
罗小舟 研究员
中国科学院深圳先进技术研究院
接下来,来自北京大学第三医院生殖中心临床干细胞研究中心的于洋研究员,带来了《利用辅助生殖技术预防罕见病的研究进展》的报告,报告指出,全球罕见病数量患者数量逐年增加,虽然罕见病药物研发及获批的数量也逐年增长,但在罕见病的三级防控策略中,预防罕见病患儿出生才是核心,随着单细胞测序技术的发展,胚胎植入前遗传学检测技术已经从染色体诊断为主逐渐过渡到基因诊断层面,并开发基于表观遗传学 DNA 甲基化的检测技术,可以同时预测胚胎植入潜能,完成基因组整倍性筛查。于洋教授详细讲解了团队开发的单细胞单线粒体 DNA 检测技术 iMiseq,通过这项技术,可以对女性生殖细胞的线粒体遗传特征进行解析,为后续丰富植入前遗传学检测技术提供了新的策略。他认为,辅助生殖技术对于预防罕见病来说,是非常有效的临床手段。
于洋 研究员
北京大学第三医院生殖中心临床干细胞研究中心
上述报告中使用到的实验技术呈现出对自动化操作、反应体系微量化的需求。然而传统的基于细胞的蛋白表达方法在速度、通量和难以自动化等方面存在局限性,这同时也制约了高效组装 DNA 技术的发展。针对这一局限,来自 NEB 的科学家 Dr. Jackson Buss 分享了我们在自动化工作流程上的经验。该工作流程将分子克隆与无细胞蛋白表达(CFPS)相结合,在数小时内就能生产出足以满足分析用量的各种蛋白质。经过优化后,CFPS 反应体系可以缩小约 100 倍,同时活性不会有明显损失。
Dr. Jackson Buss, Research Scientist III Research Nucleic Acid Replication, NEB
来自云舟生物的首席技术官蒙伟能先生带来了《IVT mRNA 药物开发创新工艺探索》的报告,报告对体外转录 mRNA 疫苗疗法获得成功的原因进行了分析,同时详细论述 mRNA 如何从实验室走向临床的历程。在报告中蒙伟能先生展示了如何建立高质量 mRNA 疫苗临床前和临床开发的综合平台,以及在 mRNA、circRNA 和 saRNA 的设计和优化方面的诸多工作,这些工作都取得了良好效果。报告表明,与病毒载体相比,mRNA 有着独特的优势。目前,有数百项正在进行的临床研究将 IVT mRNA 的应用从疫苗扩展到肿瘤学、遗传性疾病的蛋白质替代等领域。最后蒙伟能先生还强调公司已经建立了专门的方法开发及验证平台,和用于临床开发的 GMP mRNA 生产平台,全面助力 mRNA IVT 从研究阶段过渡到临床试验。
蒙伟能 CTO
云舟生物科技(广州)股份有限公司
来自 NEB 的科学家 Dr. Chen Song 详细介绍了 NEBNext® 高效文库制备流程,这些流程旨在提高 NGS 文库制备的效率和质量。NEBNext® 是 NEB 开发的一系列文库制备试剂和实验流程,它们为 DNA 和 RNA 测序提供了简化的解决方案,并在多种应用中发挥作用,包括生物标志物检测。报告现场, Dr. Chen Song 还重点介绍了最新一代的 NEBNext® 文库制备产品的卓越功能,这些新产品包括以快速、简化、高效著称的 NEBNext UltraExpress® 文库制备试剂盒,以及全新上市的针对 MGI® 测序平台的 NEBNext® 文库制备试剂盒。
Dr. Chen Song, Manager
Applications & Product Development, NEB
江苏先思达生物科技有限公司董事会秘书谢可辉先生在《糖组市场的格局、框架与未来》报告中分享了糖组学的最新进展。凭借丰富的生物产业经验,谢可辉先生深入分析了糖组学在疾病诊断、药物开发和食品科学等领域的广泛应用及先思达生物在该领域取得的显著进展,他强调尽管目前面临技术和政策挑战,糖组学市场的巨大潜力预示着其在精准医疗中将扮演更加关键的角色。
谢可辉 董事会秘书
先思达 (南京)生物科技有限公司
最后,NEB 中国区总经理 Dr. Timothy Wong 在闭幕致辞中强调:「NEB 第八届创新技术论坛的成功举办,不仅展示了 NEB 在全球生命科学领域的领导地位,也体现了我们对中国市场的长期承诺。我们期待与各位合作伙伴共同推动科学创新,为人类健康事业贡献力量。」