COVID-19 重症患者的基因组数据可能帮助我们了解新冠的遗传易感性。
2020 年 5 月 13 日，英国政府宣布了一项新的群体基因组学项目，旨在探索 COVID-19 的宿主遗传易感因素。该计划将由 Illumina 的合作伙伴 Genomics England 牵头，在与危重症死亡率遗传学联盟（GenOMICC）和英国国家医疗服务体系（NHS）共同承担该项研究。Illumina 非常荣幸能够参与其中，通过基因测序帮助研究者进一步加深对新冠疫情的认知。
由于 COVID-19 并非对所有感染者都具有生命危险，因此通过解读个人基因组，研究者将可能识别出导致个体对病毒反应差异的基因变异。该研究将收集英国 20,000 名 COVID-19 重症患者的基因组，以及 15,000 名轻度至中度疾病患者的基因组序列进行比较。这些基因组数据还将与 Genomics England 已有的 100,000 基因组计划的基因数据进行比较。Illumina 将通过其在英国运营的测序实验室为所有 35,000 个样本进行全基因组测序并提供支持。
上个月初，GenOMICC 研究被英国国立卫生研究院紧急指定为承担 COVID-19 项目的单位之一，并已经从多家医院招募重症患者。此次将借助 Genomics England 在人类全基因组序列分析经验和优势，依托爱丁堡大学，多个 NHS 站点和 Illumina 测序实验室的设施共同完成。该研究的结果还将与 Genomics England 的 100,000 人基因组计划和 UK Biobank 两个群体遗传学项目进行关联分析，将筛选并囊括这两个项目已有参与者中的所有 COVID-19 个体。项目所有数据都将被存储在英国境内的多个安全数据中心，以便于研究人员快速访问。
这项具有开创性的人类基因组研究将有助于解释为何部分 COVID-19 患者仅受到轻度感染，而另一些患者则需要重症监护，甚至某些患者尽管接受了救治最终仍然死亡。其他围绕病毒基因组测序的研究工作也将为流行病提供重要线索，GenOMICC / Genomics England 项目的全基因组数据将关联 Sanger 中心主导的 CoG-UK 联盟的病毒测序结果，该中心最近完成了 10,000 个病毒基因组测序。
目前，英国正在进行的大规模群体基因组学研究将为从基因组研究的角度解读流行病提供全新的科学思路，助力深入了解 COVID-19，并为未来的流行病的战略规划和快速响应提供科学依据。
图片来源：Illumina