合作旨在通过结合全面的测序工作流程与完善的临床信息学，加速 NGS 在临床传染性疾病检测领域的应用。
Illumina 公司（纳斯达克股票代码：ILMN）昨日宣布与 IDbyDNA 公司，一家为检测、鉴定和解读微生物及其在人类健康中的作用设定标准的宏基因组技术公司建立全球战略合作伙伴关系，共同为全球微生物市场提供基于新一代测序（NGS）的全面工作流程。
根据协议条款，Illumina 和 IDbyDNA 将共同推广 IDbyDNA 的 Explify®平台与 Illumina 的 NGS 测序平台和文库制备产品，将这些产品搭配使用能为感染性疾病应用提供完整的一体化工作流程解决方案。此外，IDbyDNA 和 Illumina 还将共同开发仅供研究使用（RUO）的工作流程。
此次合作旨在推动 NGS 测序平台、文库制备试剂以及其他试剂的广泛应用，为世界各地的实验室和医院提供高保真度的 NGS 分析、解读和报告能力。其目标是加速和改善感染性疾病检测。在 COVID-19 大流行期间，两家公司已经加快了合作的进程，以此来为全球开展 NGS 的客户提供更好的支持，帮助他们进行监测。
除了已经对 COVID-19 的监测提供的支持外，最初的商业化 RUO 工作流程还将重点关注多种类型的感染，尤其是那些使用 NGS 比使用当前技术更有独特价值的感染，同时也会继续支持 COVID-19 的监测。这些工作流程利用了 Illumina 的文库制备试剂和 NGS 测序平台，以及 IDbyDNA 的 Explify 平台。其目标是帮助实验室开发能全面鉴定病原体，同时还能提供抗菌耐药性标记相关信息的检测。
「基于 NGS 的宏基因组检测能够最全面地检测成百上千种病原体，既可用于常规检测，也可用于新出现的公共卫生威胁，例如导致 COVID-19 疫情的 SARS-CoV-2 病毒。更重要的是，我们不仅能够确定这种新出现的病毒的存在，而且还能破译单个病毒株的基因组，从而比较各个病毒株，将它们与其他冠状病毒区分开来，并在诊断时就进行监测活动，」IDbyDNA 公司的 CCO Jeff Field 说道，「随着全球旅行的增加和经济一体化，监测和追踪新型冠状病毒等病原体的传播能力成为了一项重大的公共卫生挑战。通过与 NGS 领域的领导者合作，我们计划让 Explify 平台迅速成为全球感染性疾病诊断和监测领域的新标准。」
在美国将 IDbyDNA 与 Illumina 的产品首次结合使用起来的临床实验室是位于阿拉巴马州的 Synergy 实验室。Synergy 目前正在提供基于 NGS 的尿道感染（UTI）综合性检测，其中包括约 100 种尿路病原体、定量分析和 371 种精选的抗生素耐药性遗传标记，该检测会使用 Explify 平台来分析结果。
「我们意识到基于 NGS 的微生物学检测是感染性疾病检测的未来，因此我们正在与 Illumina 和 IDbyDNA 合作，将这项新技术引入美国东南部市场，并开始为我们的临床医生和患者提供目前最全面的感染性疾病检测，」Synergy 实验室 CEO Brad Pitts 说道。
IDbyDNA Explify 平台与 Illumina NGS 测序仪和试剂的结合，旨在为微生物学市场提供商业化的工作流程解决方案，帮助实验室和医院进行基于 NGS 的全面诊断，包括广泛的病原体检测、抗菌耐药性检测和定量分析，从患者样本中更快地获得更多信息。
关于 Explify
Explify 平台可以同时分析任何样本中数以万计的微生物和病原体，为医疗保健人员提供有用的信息。该工作流程解决方案能够让实验室针对感染性疾病提供基于 NGS 的宏基因组检测。Explify 平台能管理实验室的工作流程，分析宏基因组数据，并提供用于临床审查、质量控制和报告的应用程序。Explify 为实验室提供了一种简化的方法，能让其提供基于 NGS 的实验室自主研发的检测方法（LDT），这种方法会更加全面且无偏倚。Explify 宏基因学分析是一个专有的 DNA 搜索引擎，可在几分钟内分析数千万个新一代测序 read，能够检测数万种不同的微生物。专有的 Explify 数据库包含数百万个精选的 DNA 和 RNA 参考序列，可鉴定 50,000 多种微生物和 3,000 多种已知的常见和罕见病原体，包括抗菌耐药性（AMR）。
关于 IDbyDNA
IDbyDNA 已经开发出了革命性的宏基因组技术，可以同时分析任何样本中数以万计的微生物和病原体。我们和全球的合作伙伴正在一起为鉴定和了解微生物及其在人类健康中的作用设定标准。www.idbydna.com
关于 Illumina
Illumina 公司通过解码基因组而改善人类健康。我们注重创新，这使我们成为 DNA 测序和芯片技术的全球领导者，并为科研、临床和应用市场的客户提供服务。我们的产品应用在生命科学、肿瘤学、生殖保健、农业及其他新兴市场上。如需了解更多信息，请访问 www.illumina.com.cn 或关注@illumina。
关于 Synergy 实验室
Synergy 实验室是一个提供全方位服务的诊断实验室，它可以利用各种创新平台来改善患者护理。 Synergy 成立于 2015 年，由 Brad Pitts 和 Brandon Biles 创立，其使命是为医疗保健领域提供合乎道德规范的服务，并为医疗保健人员提供优质的服务和准确的结果。近年来，Synergy 一直在引进最新技术来为不断增长的客户群提供服务。 其中有许多令人激动的消息。如需了解更多信息，请访问 www.synergytesting.com，或通过 LinkedIn 与我们联系，您还可以关注@SynergyTests。
图片来源：Illumina