美国国立综合癌症网（NCCN）根据肿瘤研究结果制定肿瘤的治疗指南每年不断更新。甲状腺肿瘤治疗指南由来自内分泌科、头颈外科、肿瘤外科、肿瘤内科、病理科、内科、核医学科、耳鼻喉科的专家共同制定。与美国甲状腺学会（American Thyroid Association，ATA）证据分类不同，NCCN 指南依据循证医学的证据及共识将治疗建议分为 4 类，1 类：建议基于较高的循证医学证据（如随机对照研究），且专家组达成一致共识；2A 类：建议基于较低级别的循证医学证据，专家组达成一致共识；2B 类：建议基于较低级别的循证医学证据，专家组未能达成共识，但并非主要分歧；3 类：建议基于任一级别的医学证据，专家组存在较大分歧。需要指出的是，由于分化良好的甲状腺癌占甲状腺癌的 90% 以上，病人存活时间很长，大样本的随机对照研究较困难，目前对于甲状腺癌大样本的研究结果来自回顾性研究，而且不同研究结果之间存在一定差异，因此指南的建议均为 2A 类。如专家组存在分歧或较大分歧，建议级别分别降低为 2B 或 3 类。
相对于 2009 年的甲状腺肿瘤治疗指南，2010 年版的新指南（以下简称新指南）对主要治疗原则进行了更详细的补充和完善：
（1）新指南将需要处理的甲状腺结节直径由 1.0cm 增加至 1.5cm，如无恶性证据可观察随诊，而且对直径<1.0cm 的微小癌手术范围可适当减小：对于分化良好的甲状腺微小癌行甲状腺全切除术似无必要，而处理直径<1.0cm 的单侧髓样癌时，新指南将原来的甲状腺全切除＋双侧中央区清扫（Ⅵ区）更改为甲状腺全切除＋考虑行中央区清扫（Ⅵ区）。
（2）增加对甲状腺激素（TSH）降低的高功能腺瘤的治疗举措。对TSH 降低的腺瘤首先选择核素扫描，如果发现为热结节，以高功能腺瘤多见，应治疗甲状腺毒性症状，从而避免手术干预。
（3）所有甲状腺癌手术前均建议进行声带检查，建议级别由 2B 升至 2A。
（4）特别指出TSH 抑制性治疗应个体化，权衡治疗效果及甲状腺素水平过高引起的副反应，老年病人注意心动过速，绝经后妇女注意脱钙、甲状腺毒性症状，并将维生素 D 的推荐剂量由 800U/d 提高至 1000U/d。
（5）核素治疗的时间在术后 1~12 周改至 2~12 周。
（6）对于髓样癌的治疗，新指南更新较多。对有淋巴结转移及血清降钙素>400ng/L 的髓样癌病人可行 MRI 检查；对不伴有甲状旁腺功能亢进的病人行颈部 B 超检查（推荐级别由 2B 级至 2A 级）；对病变广泛或中央区淋巴结转移的病人行预防性的侧颈清扫术；强调对病变残留或侵犯广泛的病人进行补充或辅助放射治疗；对降钙素或癌胚抗原（CEA）升高而无症状或影像学证据的病人复查时间由 1 年改为 6~12 个月；同时，髓样癌病人术后应补充左旋甲状腺素将 TSH 保持在正常范围内。
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美国国立综合癌症网（NCCN）2010 年版甲状腺肿瘤治疗指南解读
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