近年来，全球基因组学地行业应用不断取得突破，DNA 测序成本持续降低，每个人的基因组测序成本从 30 亿美元下降到 2014 年的 1,000 美元。在临床应用上，基因检测不仅能够追踪传染病途径，还能预测个体化疾病发生概率，从而为后续的预防和治疗提供有效的帮助。
2019 年 CSCO 学术年会上，求臻医学举办了「求无止境·臻准践行」专题卫星会，关于基因检测在肿瘤临床转化的进行了精彩讨论。丁香园作为行业内一流平台，现场采访了求臻医学首席医学官王东亮博士，深度探讨基因检测在临床应用方面的现状及未来发展。
求臻医学科技（北京）有限公司联合创始人、副总裁兼首席医学官王东亮博士接受丁香园现场采访
丁香园：王东亮博士您好，中国基因检测市场目前正处于高增长状态，求臻医学为了满足市场需求，在推动基因检测技术向临床转化方面，主要做了哪些工作？
王东亮博士：虽然中国肿瘤基因检测市场蓬勃发展，但目前行业中仍存在几大重要问题：
（1）NGS临床缺乏行业标准。多家机构对于同一份样本，会产出多个差异显著的检测结果；
（2）行业之间存在数据壁垒。尽管中国基因检测数量庞大，但医生之间、医院之间的基因数据没有横向沟通，存在信息孤岛，导致很多基因数据缺乏临床表现支持，即临床治疗后关于疗效、愈后、不良反应之间的关联。
（3）中国肿瘤患者的基因图谱缺失。
基于这些基因检测行业亟待解决的问题，由国家人类遗传资源中心牵头，求臻医学承办的中国肿瘤基因图谱计划已经全面开展。来自全国50多家三甲医院的专家，正在研究包含乳腺癌、胃癌、肠癌、肺癌、肝癌等项目的课题，以期绘制中国肿瘤基因图谱，建立行业标准、制定专家共识。
丁香园：中国肿瘤基因图谱关于行业标准制定是否有具体规划？
王东亮博士：预计三年内将检测 1 万例肿瘤患者样本，并对这 1 万例样本患者的疗效、愈后进行定期随访和跟踪，以收集临床数据绘制中国肿瘤的基因图谱，并制定行业相关标准，建立基因数据库。
丁香园：在进行肿瘤基因检测时，既有针对某一癌种常见基因变异的小panel检测，也有类似 TSO500 这种涉及上百个基因的大 panel 。二者的应用场景各是怎样的？
王东亮博士：小 panel 是单基因或者少数基因的组合，能够指导患者的靶向用药。但现在不仅是靶向治疗时代，更是免疫治疗的时代。免疫治疗有两个非常重要的标志物——肿瘤突变负荷简称 TMB ，以及微卫星不稳定状态简称 MSI 。这两个指标都需大 panel 才能更好地被检测出来，对免疫治疗进行指导。
且在临床治疗过程中，肿瘤基因组非常复杂，单看某个基因突变，临床治疗效果千差万别，若有别的基因同时突变，也对临床用药影响巨大。因此，大 panel 的基因检测结果将影响患者用药的疗效，帮助临床医生将靶向药的效果发挥到极致。
丁香园：在临床应用方面，大小 panel 是否有优劣之分？
王东亮博士：谈不上优劣之分，患者可以根据自身对于治疗疗效的预期或者治疗方案进行选择。例如，有些患者的经济承受能力只局限于进入医保的靶向药，选择小 panel 即可。但有些患者追求靶向治疗疗效最大化，可以选择大 panel 。
丁香园：随着测序成本不断下降，基因检测的数据量也愈发庞大，这对生物信息水平和遗传咨询能力提出了较高的要求。您如何看待这一问题？求臻医学是怎样帮助解决这一问题的？
王东亮博士：大数据时代，更要的是如何深度挖掘基因检测的临床数据，以更好地解决临床问题。求臻医学首席科学家李卫教授是全球顶尖的生物信息专家，对于大数据的处理和挖掘，以及升级算法造诣非常深。
肿瘤免疫治疗非常重要的一个标志物就是微卫星不稳定状态。微卫星不稳定状态算法的全球首创者——牛北方教授是求臻医学首席信息官。他基于人工智能机器学习的办法，使庞大的基因检测数据库能更好地与临床治疗结合。
丁香园：近年来兴起的免疫治疗被认为是有可能将癌症变为慢性病的疗法。不过，由于免疫系统的复杂性，目前筛选受益患者的方法尚不能完全令人满意，您认为解决这一问题的方向有可能在哪里？
王东亮博士:通过TMB、MSI的筛查，能够使患者获得免疫治疗最大疗效，但目前各类检测机构的算法结果差异较大。求臻医学联合 Illumina 等国际顶尖的企业及科研机构，开展了「 TMB 一致性的评价」项目，共同推进 TMB 更好地解决临床免疫治疗问题。
丁香园：在精准医学理念深入人心的当下，医生与患者对肿瘤基因检测的接受度日益提高。在您看来，基因检测应用于指导诊断与治疗，目前还有哪些不足的短板有待加强？
王东亮博士：基因检测是一项先进的技术，但与临床应用之间仍有脱节。首先，基因检测包含样本采集、运输、提取、建库、上机、生物信息分析、遗传咨询、报告解读等等流程，过程链条长，临床医生却并没有很好地参与各个环节。其次，临床医生对基因检测技术了解不深，而基因检测企业的研发技术临床应用性也不强。
为了解决这类难题，求臻医学根据临床应用问题、医学架构，与临床医生进行深度交流，扎根临床解决实际需求。力争打通先进技术和临床医生之间鸿沟。
丁香园：求臻医学在推动基因检测更好落地的过程中具体有哪些举措？
王东亮博士：一方面，求臻医学承办了由国家人类遗传资源中心牵头的中国肿瘤基因图谱计划，有希望能够解决 NGS 行业标准欠缺、基因检测数据壁垒、中国基因图谱缺失等问题；另一方面，求臻医学引进了全球最顶尖的肿瘤基因检测产品—— TSO 500 。这款产品由 Ilumina 研发，已获得 FDA 突破性器械待遇，将受到优先审查资源。它依据标准化测序流程、双端 UMI 设计、严谨的研发、验证数据，可以更优化的解决肿瘤领域的临床问题。
靶向用药及算法的发展日新月异，肿瘤基因检测每一天都在改变临床实践。在采访的最后，王东亮博士也通过丁香园表示，希望未来行业企业能够一起携手，在算法、检测结果验证、技术研发上，以临床问题为出发点，切实地解决患者的需求，更好地实现「健康中国 2030 」的愿景。