领星发表学术论文,初探中国肿瘤患者免疫治疗预后标志物的分布及相关性

2019-07-15 16:41 来源:丁香园 作者:
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近日,领星与中国人民解放军总医院的焦顺昌教授以及上海长征医院的臧远胜教授合作撰写的学术论文「Comprehensive analysis of potential immunotherapy genomic biomarkers in 1,000 Chinese patients with cancer」已被 Cancer Medicine(IF:3.202)杂志接收。


自 2015 年 10 月至 2016 年 3 月,领星共收集了来自全国 20 多个省市自治区、70 多家医院共计 1179 个中国肿瘤患者的样本,包括 524 例活检标本和 655 例福尔马林固定石蜡包埋样本。


在对所有这些样本进行临床全外显子组测序后,选取其中 953 例成功测序样本的结果进行综合分析,首次初步探索了中国肿瘤患者潜在的免疫治疗基因组生物标志物(TMB、dMMR、MSI-H、PD-L1 AMP)的分布及这些标志物之间的相关性。


在该患者人群中的主要研究结果如下:

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953 例患者的癌种分布


☆ TMB-H 的发生频率为 35%,MSI-H 的发生频率为 4%,dMMR 的发生频率为 0.53%,PD-L1 AMP(扩增)的发生频率为 0.04%。

☆  不同癌种的中位 TMB 不同,包括所有癌种在内的中位 TMB 为 95。


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不同癌种及细分癌种的 TMB 分布


在这些癌种中,肺癌和结直肠癌的中位 TMB 最高,分别为 176 和 108,胃肠道间质瘤的 TMB 最低。此外,同一癌种的不同亚型 TMB 间的差异也很大,尤其是在肺癌中,肺鳞癌的中位 TMB 为 274,肺腺癌的中位 TMB 为仅为 74。


☆  在肺腺癌患者中,携带 EGFR 突变的患者的 TMB 值显著低于 EGFR 野生型的患者。


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EGFR 野生型及突变肺腺癌患者的 TMB 分布


☆  肝癌、乳腺癌和食管癌患者中 TMB- H 的发生频率比 Cancer Genome Atlas data 中报道的要高 1-3 倍。

☆  在结直肠癌及胃癌患者中,MSI-H 的发生频率最高,分别为 14% 和 4%。

☆  胃肠道间质瘤的 dMMR 发生频率较高,肝细胞癌、软组织肉瘤、肾细胞癌的 dMMR 发生频率最低。


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不同癌种及细分癌种的 dMMR 分布


细分癌种中,其它类型肺癌的 dMMR 几乎是肺腺癌/肺鳞癌的两倍;HER2 阴性乳腺癌患者的 dMMR 发生频率也显著高于 HER2 阳性/未知的乳腺癌患者。


☆  在肺鳞癌及 HER2 阳性的乳腺癌患者中,PD-L1 AMP 的发生频率最高,分别为 14.3% 和 8.8%。


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不同癌种及细分癌种的 PD-L1 AMP 分布


☆  大多数 MSI-H 及 dMMR 会同时存在 TMB-H,但其他生物标志物重叠出现的情况很少。


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TMB-H、MSI-H、dMMR 和 PD-L1 AMP 的重叠分布


76.26% 的 TMB-H 患者不同时存在其它三种生物标志物,是一种相对独立的生物标志物。


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MSI-H、MSI-L 和 MSS 患者的 TMB 分布


MSI-H 组、MSI-L 组和 MSS 组的 TMB 中值差异显著,分别为 1945、408 和 90NMS /个肿瘤。约 89% 显示为 MSI-H 状态的中国癌症患者被归为 TMB-H 组。


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pMMR 和 dMMR 结直肠癌患者的 TMB 分布


在结直肠癌患者中,dMMR 患者的中位 TMB 值显著高于 pMMR 的患者(1567 vs. 106 NSM)。


此外,在 MIS-H 患者中 PD-L1 AMP 的发生频率为 7%,dMMR 患者中 PD-L1 AMP 的发生频率为 4%,PD-L1 AMP 患者中 MSI-H/dMMR 的发生频率也均低于 10%。


以上研究结果表明除 MSI-H 及 dMMR 显示与 TMB-H 具有较高的相关性外,这四种生物标志物的之间的相关性均较低,提示其潜在的形成原因可能不同。因此,在进行免疫治疗疗效预测时,应对这四种生物标志物都进行评估。


此外,虽然这些生物标志物可以用来识别可能对免疫治疗有反应的癌症患者,但它们尚不能完美地预测免疫治疗的复杂性,仍需要更广泛的研究来探究新的生物标志物或生物标志物的组合。


该研究数据来源于领星「康新源千人行」项目。截至 2016 年 7 月 5 日,「康新源千人行」为所有患者完成了临床全外显子组测序(Clinical Whole-exome Sequencing, CWES,涵盖临床级别的生物信息分析和解读),并在此基础上,建立了中国最大规模的临床全外显子组数据库(涵盖全外显子组测序、生物信息分析、结合病理的临床解读和随访更新)。


未来,领星也将继续努力,帮助更多的中国肿瘤临床医生更好地治疗中国的肿瘤患者,切实为患者带去更多的帮助。


关于领星


领星医学是由中美生物医学科学家携手资深肿瘤专家共同开创的肿瘤精准医疗服务平台,是一家集精准治疗方案筛选、精准治疗实施、精准治疗监测于一体的国际化公司,致力于从信息层面到操作层面集成化的高效服务,为肿瘤患者带来实质临床获益。通过人工智能,医疗大数据的驱动,逐步优化医疗资源的配置,医疗决策的落地,打通整体化,全方位的医疗路径,为中国的肿瘤患者和医生提供个体化精准医疗的临床解决方案及面向全球资源的对接服务。

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实验室严格按照ISO15189:2012、美国临床实验室改进修正CLIA'88、美国病理学家协会(CAP)的标准建立了完善的质量管理体系,为美国医疗机构提供临床检验报告的资质,以便有效利用欧美先进医疗技术,更好地为肿瘤患者、医疗机构提供服务。

此外,领星医学还将不断扩充和完善现有数据库,打造集约化的国际化标准检测平台、服务于最先进临床研究的生物信息分析平台和中国最大且符合国际标准的临床数据库,实现产业集群联动,成为具有国际水准的精准医学创新载体。

领星医学始终秉承从精准出发,不断创新,将最新的基因检测技术应用到临床,为临床医生提供专业的分子诊断策略,为更多肿瘤患者带来曙光。


编辑: 高薇

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