喜讯:领星正式推出 b-CWES 检测产品

2018-07-31 13:39 来源:丁香园 作者:
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引言:在肿瘤精准诊疗的过程中,肿瘤组织一直是临床首选的样本类型,其检测和分析结果可用于肿瘤的诊断、分型、用药指导、疗效评估和预后判断等。然而,在某些临床场景下,常遇到无法取得肿瘤组织的情况,如病灶特殊位置、肿瘤进展,多发转移等,如何帮助这部分的患者进行准确的检测?


外周血检测肿瘤释放的循环肿瘤 DNA(circulating tumor DNA, ctDNA) 作为一类研究比较充分且相对成熟的技术,可以为这个问题带来答案。但是,想要为患者提供完善的血液 ctDNA 外显子区域测序分析服务,我们面临着以下这些极具挑战的难题:

①ctDNA 测序中大量的背景错误,这些错误是由 PCR 扩增、杂交捕获和测序过程中引入的错误造成;

②游离的 DNA 中含有大量的其他器官来源的突变,肿瘤 ctDNA 含量及突变只占总突变的一小部分;

③肿瘤组织的所有突变,在 ctDNA 也只能检测出一部分(10-60%)


要解决上述问题的基础是在确保检测敏感度的同时,尽量消除假阳性的突变结果,确保真实的 ctDNA 突变的检出


领星生信部和实验室基于这个设想和我们已有的临床全外显子组测序(Clinical Whole Exome Sequencing, CWES)技术,通过的不断的探索和持续的研发,现正式推出 b-CWES 检测产品。


b-CWES 检测产品优势


领星 b-CWES 在传统外周血 ctDNA 测序的基础上,通过分子标签技术(UMI)和分析流程优化,降低了背景噪音干扰,提高了真实的 ctDNA 低频突变的检出率。


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分子标签技术原理示意图


与传统胚系突变检测时所用的样本为 DNA 整体不同,使用单分子标签技术需以单个 DNA 分子为测序样本,然后对这些单个 DNA 分子进行一一标记,再将标记扩增后的单个 DNA 分子多次测序 (也称为高深度测序),进一步提高单个分子的单碱基准确性。在测序数据中,通过单分子标记将他们重新聚集在一起统一分析,然后通过统计一致性序列剔除零散分布的聚合酶错误和测序错误便能得到矫正后的精确序列,可用于对整个样本中的突变频率进行「绝对定量」。


在分子标签技术的加持下,b-CWES 在产品性能上有了以下几点优化:

• 降低对游离 DNA 起始量要求,提高检测成功率

• 精准评估样本中待测游离 DNA 的拷贝数,确保检测的可靠性

• 减少 90% 的假阳性突变,降低游离 DNA 放大过程中带来的背景噪音

• 敏感性增加了 10 倍以上,减少了假阴性,提高了检测的准确性

• 提供真实的血液中的肿瘤突变负荷(bTMB)、微卫星不稳定(bMSI)和拷贝数变异(bCNV)等药物评估指标


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检测项目对比


b-CWES 除了能指导靶向药物,检测耐药突变外,还能全面评估血液中的 bTMB 和 bMSI,指导免疫检查点抑制剂类药物的使用,真正帮助临床解决无组织样本情况下的用药指导和治疗规划问题。


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b-CWES 极大降低假阳性及假阴性结果


b-CWES 与组织 CWES 检测结果一致


在检测结果的准确性上,b-CWES 阳性位点与组织 CWES 一致,并且突变频率也极为接近。


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组织 CWES 与 b-CWES 突变频率检测结果比较


以一例免疫超进展原发耐药胃癌患者为例,b-CWES 可以检测驱动突变的 bCNV 及产生耐药的可能原因,指导后续的靶向用药选择并评价药物疗效。



bCNV 与免疫超进展原发耐药案例


此外,领星还将胃癌患者的 b-CWES 与组织 CWES 的 TMB 和 MSI 结果进行了比较。结果表明,b-CWES 可以很好的检测出胃癌 ctDNA 中的 TMB 和 MSI,且与组织 CWES 检测的结果相似。


领星医学信息部总监王冠表示:「以上数据可以说明 b-CWES 有实力成为在无法取得肿瘤组织的情况下替代组织 CWES 的可靠检测方法,为这部分的患者带去临床获益。」


未来,领星将在 CWES 的基础上不断完善产品组合,并对现有的产品不断升级革新,为肿瘤患者提供更全面、精准的治疗指导,成为肿瘤患者可靠的精准医疗服务平台。


关于领星

领星医学是由中美生物医学科学家携手资深肿瘤专家共同开创的肿瘤精准医疗服务平台,是一家集精准治疗方案筛选、精准治疗实施、精准治疗监测于一体的国际化公司,致力于从信息层面到操作层面集成化的高效服务,为肿瘤患者带来实质临床获益。通过人工智能,医疗大数据的驱动,逐步优化医疗资源的配置,医疗决策的落地,打通整体化,全方位的医疗路径,为中国的肿瘤患者和医生提供个体化精准医疗的临床解决方案及面向全球资源的对接服务。

领星医学检验所是领星医学和北京大学生命科学华东产业研究院联合挂牌的实验室,取得卫计委颁发的医疗机构执业许可,致力于为全国肿瘤患者或医疗机构提供以精准治疗为目的、以基因检测为核心的个体化检验项目与服务。

实验室严格按照ISO15189:2012、美国临床实验室改进修正CLIA'88、美国病理学家协会(CAP)的标准建立了完善的质量管理体系,为美国医疗机构提供临床检验报告的资质,以便有效利用欧美先进医疗技术,更好地为肿瘤患者、医疗机构提供服务。

此外,领星医学还将不断扩充和完善现有数据库,打造集约化的国际化标准检测平台、服务于最先进临床研究的生物信息分析平台和中国最大且符合国际标准的临床数据库,实现产业集群联动,成为具有国际水准的精准医学创新载体。

领星医学始终秉承从精准出发,不断创新,将最新的基因检测技术应用到临床,为临床医生提供专业的分子诊断策略,为更多肿瘤患者带来曙光。


图片来源:领星


编辑: 高薇

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