新疆生产建设兵团总医院正式成立于 1982 年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的省级综合性三甲医院。医院不仅承担着兵团、自治区广大人民群众保健的任务，还担负着兵团主要疑难危重疾病的诊治和突发公共卫生事件的救治任务。几十年的艰苦奋斗，兵团医院誉满天山，先后荣获全国扶残助残先进单位，全国残疾人三项康复工作先进单位，全国三甲医院感染工作先进单位，全国优秀价格监测定点单位，连续五年荣获自治区药品价格定点监测先进单位一等奖、连续三年荣获乌鲁木齐市医疗保险优秀定点医院和医疗保险先进单位，连续两年荣获优秀商业保险定点医院, 荣获兵团、乌市文明单位等荣誉称号。
兵团医院目前有国务院特殊津贴专家 7 人，教授、副教授 38 名，高级职称 121 人，中级职称 209 人，硕士生导师 10 人。有 231 人在国家、省、自治区、兵团各级学术团体、保健委员会中担任主任委员、秘书长等，其中主任副主任委员 25 人、秘书长副秘书长 4 人、理事常委 52 人。医院设有 30 多个临床、医技科室和 20 多个专科门诊检查、治疗处室，是石河子大学医学院第二附属医院、新疆医科大学教学医院。2005 年到 2010 年上半年，医院门诊量平均增长速度为 15.96%，出院病人数平均增长速度为 16.97%，病床使用率已达 115.19%，病床周转次平均增长速度为 15.67%，手术量平均增长速度为 16.22%。医院始终坚持「科学技术是第一生产力」，不断加大技术创新力度。
兵团医院在国内外刊物上发表学术论文 600 余篇，参加国际学术会议 20 余次，开展新技术、新项目 300 多项，获得国家、自治区及兵团科技成果奖 40 多项。同时，医院开展的脑瘫患儿干细胞移植术、主动脉夹层支架植入术、肝脏良恶性肿瘤切除及射频治疗、胰头癌十二指肠切除术、门脉高压症手术、肝包虫外壳剥离术、阴式微创手术、绿激光治疗前列腺增生、等离子体低温组织消融术、髋、膝关节置换术及在导航下开展骨科复杂手术、超声乳化加晶体植入术治疗白内障、特色中西医肛肠疾病的治疗、小儿麻痹矫治手术、冠状动脉搭桥术、心脏起搏器植入术、心脏瓣膜置换术、冠状动脉支架置入术、射频消融术、房间膈缺损封堵术、经尿道镜气压弹道碎石术、腹腔镜下交通支静脉结扎术、椎间盘镜微创治疗腰椎间盘突出症手术、静脉溶栓、动脉溶栓、缺血性卒中急性期病因诊断、临床分型及规范治疗等一系列新技术、新项目。